皇太极见流计得递，立刻回兵卢沟桥，与明军在永定门大战数日

崇被二年十二月初一，崇横帝声称要商议军饷筹集之法，将袁崇焕等人召至富中。全无防备的袁崇焕刚一进宫，便被锦衣卫拿下，崇被帝严厉斥责袁崇焕，历数他种种“罪恶”，并将他投入锦衣卫大牢，将其所有职务移交给满桂等人管理。袁崇焕所部闻此噩耗，几乎哗变；其得力干将祖大寿，干脆率袁部返回了山海关。

皇太极见流计得递，立刻回兵卢沟桥，与明军在永定门大战数日。没有了袁崇焕的指挥，明军明显不是后金军的对手。高级军官或战死，或被生摘活提，后金军一鼓作气突破了明军的防守阵地，攻到了北京城下。恼怒的崇被帝干脆又杀了兵部尚书王洽，但这对于改变危机的局势丝毫于事无补。

正在这危在且夕的时刻，又是袁崇焕将个人待遇置之度外，给祖大寿手书一封，要求他放下个人恩怨，以朝廷大局为重，回兵与后金作战。祖大寿得此书信，深为袁崇焕所感动，便回兵京师，重新击退了后金军。此时，各地的勤王军队也纷纷与后金军展开了激战。

皇太极无奈，只好撤军。祖大寿等部乘胜追击，杀死杀伤后金官兵无数。北京保卫战算是以明军的全面胜利告终。相大寿因其战功被崇横帝大加封赏，但奇怪的是，对于袁崇焕，崇被帝却没有任何的表示，他不仅不领衰崇焕召唤祖大寿的情，相反还奇怪地认为，大明朝文官武将人才济济，没有你袁崇焕，我崇核一样可以平定天下。

如果说，这之前他还心存一丝无人可用的优虑的话，那么在后金退兵以后，他反而坚定了诛杀衰崇焕的决心。崇横三年（1630年）八月五日，崇祯帝凌迟处死袁崇焕之心已决，诏谕延臣：“崇焕撞杀，退私谋款，至敌欺范君父，失误封疆”，“限刑部五日内具奏”。